Pri účtovaní transferov je jediným rozdielom medzi účtovaním v rozpočtových a príspevkových organizáciách zriadenou samosprávou bankový účet, na ktorý transfer dostávajú, a z ktorého hradia výdavky.
Príspevková organizácia používa účet 221 – Bankové účty a rozpočtová organizácia zasa prijíma transfery a následne účtuje o výdavkoch na účte 222 – Výdavkový rozpočtový účet.
Na základe toho, či ide o prostriedky od zriaďovateľa alebo zo štátneho rozpočtu poskytnuté prostredníctvom zriaďovateľa, sa odlišne účtuje príjem a zúčtovanie transferu. Ak je príjem prostriedkov