Hlavný kontrolór obce je v zmysle ustanovenia § 18 ods. 1 zákona č. 369/1990 Zb. o obecnom zriadení v z. n. p. (ďalej len „zákon o obecnom zriadení“) zamestnancom obce a ak zákon o obecnom zriadení neustanovuje inak, vzťahujú sa na neho všetky práva a povinnosti ostatného vedúceho zamestnanca podľa zákona č. 552/2003 Z. z. o výkone práce vo verejnom záujme a o zmene a doplnení niektorých zákonov v z. n. p. (ďalej len „zákon o výkone práce vo verejnom záujme“).
V súlade s § 1 ods. 4 zákona o výkone práce vo verejnom záujme sa na pracovnoprávne vzťahy zamestnancov pri výkone práce vo verejnom záujme vzťahuje zákon č. 311/2001 Z. z. Zákonník práce v z. n. p. (ďalej len „Zákonník práce“), ak zákon o výkone práce vo verejnom záujme alebo osobitný predpis neustanovuje inak (za iný osobitný predpis možno v prípade hlavného kontrolóra považovať napr. zákon o obecnom zriadení).
Z platnej právnej úpravy vyplýva, že hlavný kontrolór sa síce považuje za zamestnanca obce a výkon funkcie vykonáva v pracovnom pomere, ale jeho pracovnoprávne postavenie je veľmi špecifické, a v určitých prípadoch sa javí až ako komplikované a neprehľadné. Podľa zákona o obecnom zriadení je hlavný kontrolór v otázkach práv a povinností v postavení ostatného vedúceho zamestnanca podľa zákona o výkone práce vo verejnom záujme, kde tento zákon: